可以通過服用小蘇打的方式來中和.生理學研究和14C標記的纖維素實驗說明，生長于纖維素上的微生物的生物能量效益取決于胞內低聚糖攝取過程中β一糖苷鍵磷酸解的效率，并且這些效益超過了纖維素合成的生物能量成本。這些研究為纖維素分解菌在纖維素上快速生長提供了實驗依據和理論依據。 應用聯合生物加工的關鍵是構建出能完成多個生化反應過程的酶系統，使纖維素原料通過一個工藝環節就轉變為能源產品。一些細菌和真菌具有CBP所需要的特性，所以改造現有的微生物已成為研究的熱點。以基因重組等為代表的生物工程技術已經使這種設想成為現實，并為設計出更完善的CBP酶系統提供了可能。對相關的微生物改造主要有以下3個策略。是通過基因重組的方法表達一系列的外切葡聚糖酶和內切葡聚糖酶等纖維素酶基因，使微生物能以纖維素為唯一碳源，將來源于纖維素的糖類完全或者大部分進行發酵。 重組策略所遇到的問題有：外源基因共表達對細胞的有害性。需要在轉錄水平使外源基因適量表達一些分泌蛋白可能折疊不正確。因為纖維素降解蛋白合成之后必須要正確折疊才能分泌并行使功能。未正確折疊的蛋白分泌后要通過內質網結合蛋白降解，而且對內質網造成壓力。

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